Das operative Alltagsgeschäft der WiFF verantwortet das Deutsche Jugendinstitut in München. Dort arbeitet ein Team von 21 Personen an der Umsetzung der Projektziele. Die empirischen Forschungen der WiFF werden insbesondere in enger Zusammenarbeit mit den 3 KollegInnen des Forschungsverbundes Deutsches Jugendinstitut/Technische Universität Dortmund durchgeführt.